ZBTB32 |
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB | | |
Ідентифікатори |
---|
Символи | ZBTB32, FAXF, FAZF, Rog, TZFP, ZNF538, zinc finger and BTB domain containing 32 |
---|
Зовнішні ІД | OMIM: 605859 MGI: 1891838 HomoloGene: 8661 GeneCards: ZBTB32 |
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція | • nucleic acid binding • DNA binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific |
---|
Клітинна компонента | • клітинне ядро • нуклеоплазма |
---|
Біологічний процес | • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated |
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних |
Ортологи |
---|
Види | Людина | Миша |
---|
Entrez | | |
---|
Ensembl | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | NM_014383 NM_001316902 NM_001316903 |
| |
---|
RefSeq (білок) | | NP_001303831 NP_001303832 NP_055198 |
| |
---|
Локус (UCSC) | Хр. 19: 35.7 – 35.72 Mb | Хр. 7: 30.29 – 30.3 Mb |
---|
PubMed search | [1] | [2] |
---|
Вікідані |
Див./Ред. для людей | Див./Ред. для мишей |
|
ZBTB32 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 32) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 52 963[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MSLPPIRLPS | | PYGSDRLVQL | | AARLRPALCD | | TLITVGSQEF | | PAHSLVLAGV |
SQQLGRRGQW | | ALGEGISPST | | FAQLLNFVYG | | ESVELQPGEL | | RPLQEAARAL |
GVQSLEEACW | | RARGDRAKKP | | DPGLKKHQEE | | PEKPSRNPER | | ELGDPGEKQK |
PEQVSRTGGR | | EQEMLHKHSP | | PRGRPEMAGA | | TQEAQQEQTR | | SKEKRLQAPV |
GQRGADGKHG | | VLTWLRENPG | | GSEESLRKLP | | GPLPPAGSLQ | | TSVTPRPSWA |
EAPWLVGGQP | | ALWSILLMPP | | RYGIPFYHST | | PTTGAWQEVW | | REQRIPLSLN |
APKGLWSQNQ | | LASSSPTPGS | | LPQGPAQLSP | | GEMEESDQGH | | TGALATCAGH |
EDKAGCPPRP | | HPPPAPPARS | | RPYACSVCGK | | RFSLKHQMET | | HYRVHTGEKP |
FSCSLCPQRS | | RDFSAMTKHL | | RTHGAAPYRC | | SLCGAGCPSL | | ASMQAHMRGH |
SPSQLPPGWT | | IRSTFLYSSS | | RPSRPSTSPC | | CPSSSTT |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.
Література
- Lin W.-C., Lai C.-H., Tang C.J., Huang C.-J., Tang T.K. (1999). Identification and gene structure of a novel human PLZF-related transcription factor gene, TZFP. Biochem. Biophys. Res. Commun. 264: 789—795. PMID 10544010 DOI:10.1006/bbrc.1999.1594
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Stogios P.J., Cuesta-Seijo J.A., Chen L., Pomroy N.C., Prive G.G. (2010). Insights into strand exchange in BTB domain dimers from the crystal structures of FAZF and Miz1. J. Mol. Biol. 400: 983—997. PMID 20493880 DOI:10.1016/j.jmb.2010.05.028
Примітки
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16763 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, Q9Y2Y4 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
Див. також
| Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
Портал «Біологія» Портал «Хімія» |
|
---|
| (1) Основні домени |
---|
| (1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
| (1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
| (1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
| (1.4) NF-1 | |
---|
| (1.5) RF-X | |
---|
| (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| | (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
| (2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
| підродина 2 | |
---|
| підродина 3 | - Стероїдні гормони
- Естроген-зв'язувальні
|
---|
| підродина 4 | |
---|
| підродина 5 | |
---|
| підродина 6 | |
---|
| підродина 0 | |
---|
|
---|
| (2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
| (2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
| (2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
| (2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
| (2.6) WRKY | |
---|
|
| | (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
| (3.1) Гомеобокс | |
---|
| (3.2) Парний бокс | |
---|
| (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
| (3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
| (3.5) Триптофановий кластер | |
---|
| (3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| | (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
| (4.1) RHR | |
---|
| (4.2) STAT | |
---|
| (4.3) p53 | |
---|
| (4.4) MADS | |
---|
| (4.6) TATA | |
---|
| (4.7) Високомобільна група | |
---|
| (4.9) Grainyhead | |
---|
| (4.10) Домен холодового шоку | |
---|
| (4.11) Runt | |
---|
|
| | (0) Інші фактори транскрипції |
---|
| (0.2) HMGI(Y) | |
---|
| (0.3) Pocket домен | |
---|
| (0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
| (0.6) Інші | |
---|
|
|
|