SIX2

SIX2
Ідентифікатори
Символи SIX2, SIX homeobox 2
Зовнішні ІД OMIM: 604994 MGI: 102778 HomoloGene: 56518 GeneCards: SIX2
Онтологія гена
Молекулярна функція

DNA binding
sequence-specific DNA binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
transcription factor binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0032403 protein-containing complex binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding

Клітинна компонента

клітинне ядро
transcription regulator complex

Біологічний процес

embryonic skeletal system morphogenesis
regulation of chondrocyte differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of chondrocyte proliferation
chondrocyte differentiation
protein import into nucleus
розвиток нирки
negative regulation of cell differentiation
anatomical structure morphogenesis
mesenchymal stem cell maintenance involved in nephron morphogenesis
mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis
mesenchymal cell differentiation involved in kidney development
mesenchymal stem cell proliferation
transcription by RNA polymerase II
regulation of branching involved in ureteric bud morphogenesis
multicellular organism development
nephron morphogenesis
nephron development
middle ear morphogenesis
embryonic digestive tract morphogenesis
embryonic cranial skeleton morphogenesis
regulation of ossification
проліферація
mesodermal cell fate specification
anterior/posterior axis specification
metanephros development
cell migration
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
condensed mesenchymal cell proliferation
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:1903374 anatomical structure development

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
10736
20472
Ensembl
ENSG00000170577
ENSMUSG00000024134
UniProt
Q9NPC8
Q8TBA2
Q62232
RefSeq (мРНК)
NM_016932
NM_011380
RefSeq (білок)
NP_058628
NP_058628.3
NP_035510
Локус (UCSC) Хр. 2: 45.01 – 45.01 Mb Хр. 17: 85.99 – 86 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SIX2 (англ. SIX homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 291 амінокислот, а молекулярна маса — 32 286[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSMLPTFGFTQEQVACVCEVLQQGGNIERLGRFLWSLPACEHLHKNESVL
KAKAVVAFHRGNFRELYKILESHQFSPHNHAKLQQLWLKAHYIEAEKLRG
RPLGAVGKYRVRRKFPLPRSIWDGEETSYCFKEKSRSVLREWYAHNPYPS
PREKRELAEATGLTTTQVSNWFKNRRQRDRAAEAKERENNENSNSNSHNP
LNGSGKSVLGSSEDEKTPSGTPDHSSSSPALLLSPPPPGLPSLHSLGHPP
GPSAVPVPVPGGGGADPLQHHHGLQDSILNPMSANLVDLGS

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10888 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q9NPC8 (англ.) . Архів оригіналу за 10 жовтня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 2
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші