TP63

TP63
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4A9Z, 1RG6, 2RMN, 2Y9T, 2Y9U, 3QYM, 3QYN, 3US0, 3US1, 3US2, 3ZY0, 3ZY1

Ідентифікатори
Символи TP63, AIS, B(p51A), B(p51B), EEC3, KET, LMS, NBP, OFC8, RHS, SHFM4, TP53CP, TP53L, TP73L, p40, p51, p53CP, p63, p73H, p73L, tumor protein p63
Зовнішні ІД OMIM: 603273 MGI: 1330810 HomoloGene: 31189 GeneCards: TP63
Пов'язані генетичні захворювання
adenocarcinoma of the lung, lymphoblastic leukemia, рак легень, ADULT syndrome, Limb–mammary syndrome, ankyloblepharon-ectodermal defects-cleft lip/palate syndrome, split hand-foot malformation 2[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
зв'язування з іоном металу
damaged DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
WW domain binding
double-stranded DNA binding
DNA binding
sequence-specific DNA binding
identical protein binding
chromatin binding
p53 binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
MDM2/MDM4 family protein binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
protein domain specific binding

Клітинна компонента

цитоплазма
neuron projection
клітинне ядро
rough endoplasmic reticulum
transcription regulator complex
нуклеоплазма
дендрит (нейробіологія)
мітохондрія
комплекс Ґольджі
гіалоплазма
GO:0009327 protein-containing complex

Біологічний процес

pattern specification process
skeletal system development
epithelial cell development
negative regulation of keratinocyte differentiation
epidermal cell division
anatomical structure formation involved in morphogenesis
prostate gland development
transcription by RNA polymerase II
squamous basal epithelial stem cell differentiation involved in prostate gland acinus development
ectoderm and mesoderm interaction
cellular response to DNA damage stimulus
female genitalia morphogenesis
odontogenesis of dentin-containing tooth
prostatic bud formation
positive regulation of cell cycle G1/S phase transition
positive regulation of mesenchymal cell proliferation
Сперматогенез
multicellular organism aging
smooth muscle tissue development
positive regulation of fibroblast apoptotic process
animal organ morphogenesis
hair follicle morphogenesis
positive regulation of Notch signaling pathway
GO:0097285 апоптоз
ремоделювання хроматину
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
regulation of neuron apoptotic process
positive regulation of apoptotic signaling pathway
regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process
transcription, DNA-templated
embryonic limb morphogenesis
negative regulation of mesoderm development
epidermis development
post-anal tail morphogenesis
response to gamma radiation
protein homotetramerization
Сигнальний шлях Notch
hair follicle development
neuron apoptotic process
polarized epithelial cell differentiation
proximal/distal pattern formation
диференціація клітин
positive regulation of keratinocyte proliferation
skin morphogenesis
epithelial cell differentiation
urinary bladder development
cellular response to UV
establishment of planar polarity
negative regulation of apoptotic process
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
protein tetramerization
keratinocyte proliferation
positive regulation of osteoblast differentiation
regulation of epidermal cell division
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of cellular senescence
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator
sympathetic nervous system development
establishment of skin barrier
morphogenesis of a polarized epithelium
keratinocyte differentiation
multicellular organism development
mitotic G1 DNA damage checkpoint signaling
cloacal septation
response to X-ray
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator
positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway
regulation of signal transduction by p53 class mediator
regulation of apoptotic process
GO:0010260 старіння людини
negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
positive regulation of somatic stem cell population maintenance
проліферація
epidermal cell differentiation
embryonic forelimb morphogenesis
embryonic hindlimb morphogenesis
skin epidermis development
cranial skeletal system development
GO:0007571 розвойовий процес

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8626
22061
Ensembl
ENSG00000073282
ENSMUSG00000022510
UniProt
Q9H3D4
O88898
RefSeq (мРНК)
NM_001114978
NM_001114979
NM_001114980
NM_001114981
NM_001114982
NM_003722
NM_001329144
NM_001329145
NM_001329146
NM_001329148
NM_001329149
NM_001329150
NM_001329964
NM_001127259
NM_001127260
NM_001127261
NM_001127262
NM_001127263
NM_001127264
NM_001127265
NM_011641
RefSeq (білок)
NP_001108450
NP_001108451
NP_001108452
NP_001108453
NP_001108454
NP_001316073
NP_001316074
NP_001316075
NP_001316077
NP_001316078
NP_001316079
NP_001316893
NP_003713
NP_001120731
NP_001120732
NP_001120733
NP_001120734
NP_001120735
NP_001120736
NP_001120737
NP_035771
Локус (UCSC) Хр. 3: 189.63 – 189.9 Mb Хр. 16: 25.5 – 25.71 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TP63 (англ. Tumor protein p63) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 680 амінокислот, а молекулярна маса — 76 785[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MNFETSRCATLQYCPDPYIQRFVETPAHFSWKESYYRSTMSQSTQTNEFL
SPEVFQHIWDFLEQPICSVQPIDLNFVDEPSEDGATNKIEISMDCIRMQD
SDLSDPMWPQYTNLGLLNSMDQQIQNGSSSTSPYNTDHAQNSVTAPSPYA
QPSSTFDALSPSPAIPSNTDYPGPHSFDVSFQQSSTAKSATWTYSTELKK
LYCQIAKTCPIQIKVMTPPPQGAVIRAMPVYKKAEHVTEVVKRCPNHELS
REFNEGQIAPPSHLIRVEGNSHAQYVEDPITGRQSVLVPYEPPQVGTEFT
TVLYNFMCNSSCVGGMNRRPILIIVTLETRDGQVLGRRCFEARICACPGR
DRKADEDSIRKQQVSDSTKNGDGTKRPFRQNTHGIQMTSIKKRRSPDDEL
LYLPVRGRETYEMLLKIKESLELMQYLPQHTIETYRQQQQQQHQHLLQKQ
TSIQSPSSYGNSSPPLNKMNSMNKLPSVSQLINPQQRNALTPTTIPDGMG
ANIPMMGTHMPMAGDMNGLSPTQALPPPLSMPSTSHCTPPPPYPTDCSIV
SFLARLGCSSCLDYFTTQGLTTIYQIEHYSMDDLASLKIPEQFRHAIWKG
ILDHRQLHEFSSPSHLLRTPSSASTVSVGSSETRGERVIDAVRFTLRQTI
SFPPRDEWNDFNFDMDARRNKQQRIKEEGE

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Augustin M., Bamberger C., Paul D., Schmale H. (1998). Cloning and chromosomal mapping of the human p53-related KET gene to chromosome 3q27 and its murine homolog Ket to mouse chromosome 16. Mamm. Genome. 9: 899—902. PMID 9799841 DOI:10.1007/s003359900891
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Kim E.-J., Park J.-S., Um S.-J. (2002). Identification and characterization of HIPK2 interacting with p73 and modulating functions of the p53 family in vivo. J. Biol. Chem. 277: 32020—32028. PMID 11925430 DOI:10.1074/jbc.M200153200
  • Zeng S.X., Dai M.-S., Keller D.M., Lu H. (2002). SSRP1 functions as a co-activator of the transcriptional activator p63. EMBO J. 21: 5487—5497. PMID 12374749 DOI:10.1093/emboj/cdf540
  • Li Y., Zhou Z., Chen C. (2008). WW domain-containing E3 ubiquitin protein ligase 1 targets p63 transcription factor for ubiquitin-mediated proteasomal degradation and regulates apoptosis. Cell Death Differ. 15: 1941—1951. PMID 18806757 DOI:10.1038/cdd.2008.134
  • Zheng M.Z., Zheng L.M., Zeng Y.X. (2008). SCC-112 gene is involved in tumor progression and promotes the cell proliferation in G2/M phase. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 134: 453—462. PMID 17846787 DOI:10.1007/s00432-007-0306-x

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з TP63 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15979 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
  5. UniProt, Q9H3D4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 3
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Фактори транскрипції та внутрішньоклітинні рецептори
 
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль
/ Лейцинова застібка
(bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
 
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4)
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
  • WRKY
 
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
 
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
 
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
  • AP2
  • EREBP
  • B3
(0.6) Інші