RBMY1A1

Наявні структури

Пошук для людей: PDBe RCSB

Список кодів PDB
2FY1

Ідентифікатори

Символи

RBMY1A1, RBM, RBM1, RBM2, RBMY, RBMY1C, YRRM1, YRRM2, RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A1, RNA binding motif protein Y-linked family 1 member A1

Зовнішні ІД

OMIM: 400006 HomoloGene: 121598 GeneCards: RBMY1A1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • RNA binding • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• клітинне ядро • nuclear speck
Біологічний процес	• mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • mRNA cis splicing, via spliceosome
Джерела:Amigo / QuickGO

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5940


н/д

Ensembl


ENSG00000234414


н/д

UniProt


P0DJD3


н/д

RefSeq (мРНК)


NM_005058 NM_001320944 NM_001320945


н/д

RefSeq (білок)

NP_001307873 NP_001307874 NP_005049 NP_001006120 NP_001307878
NP_001307879


н/д

Локус (UCSC)

Хр. Y: 21.51 – 21.55 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

н/д

Вікідані

Див./Ред. для людей

RBMY1A1 (англ. RNA binding motif protein, Y-linked, family 1, member A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 496 амінокислот, а молекулярна маса — 55 784^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MVEADHPGKL	FIGGLNRETN	EKMLKAVFGK	HGPISEVLLI	KDRTSKSRGF
AFITFENPAD	AKNAAKDMNG	KSLHGKAIKV	EQAKKPSFQS	GGRRRPPASS
RNRSPSGSLR	SARGSRGGTR	GWLPSHEGHL	DDGGYTPDLK	MSYSRGLIPV
KRGPSSRSGG	PPPKKSAPSA	VARSNSWMGS	QGPMSQRREN	YGVPPRRATI
SSWRNDRMST	RHDGYATNDG	NHPSCQETRD	YAPPSRGYAY	RDNGHSNRDE
HSSRGYRNHR	SSRETRDYAP	PSRGHAYRDY	GHSRRDESYS	RGYRNRRSSR
ETREYAPPSR	GHGYRDYGHS	RRHESYSRGY	RNHPSSRETR	DYAPPHRDYA
YRDYGHSSWD	EHSSRGYSYH	DGYGEALGRD	HSEHLSGSSY	RDALQRYGTS
HGAPPARGPR	MSYGGSTCHA	YSNTRDRYGR	SWESYSSCGD	FHYCDREHVC
RKDQRNPPSL	GRVLPDPREA	CGSSSYVASI	VDGGESRSEK	GDSSRY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Hofmann Y., Wirth B. (2002). hnRNP-G promotes exon 7 inclusion of survival motor neuron (SMN) via direct interaction with Htra2-beta1. Hum. Mol. Genet. 11: 2037—2049. PMID 12165565 DOI:10.1093/hmg/11.17.2037
Elliott D.J. (2004). The role of potential splicing factors including RBMY, RBMX, hnRNPG-T and STAR proteins in spermatogenesis. Int. J. Androl. 27: 328—334. PMID 15595951 DOI:10.1111/j.1365-2605.2004.00496.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9912 (англ.) . Процитовано 13 вересня 2017.
↑ UniProt, P0DJD3 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2017. Процитовано 13 вересня 2017.