PSMD8

Ідентифікатори

Символи

PSMD8, HEL-S-91n, HIP6, HYPF, Nin1p, Rpn12, S14, p31, proteasome 26S subunit, non-ATPase 8

Зовнішні ІД

OMIM: 617844 MGI: 1888669 HomoloGene: 37686 GeneCards: PSMD8

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding
Клітинна компонента	• нуклеоплазма • клітинне ядро • proteasome regulatory particle, lid subcomplex • proteasome regulatory particle • proteasome accessory complex • екзосома • гіалоплазма • Протеасома
Біологічний процес	• NIK/NF-kappaB signaling • протеоліз • MAPK cascade • proteasome assembly • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • Fc-epsilon receptor signaling pathway • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of protein stability • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • positive regulation of protein targeting to mitochondrion • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


5714


57296

Ensembl


ENSG00000099341


ENSMUSG00000030591

UniProt


P48556


Q9CX56

RefSeq (мРНК)


NM_002812


NM_026545

RefSeq (білок)


NP_002803


NP_080821

Локус (UCSC)

Хр. 19: 38.37 – 38.38 Mb

Хр. 7: 28.87 – 28.88 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

PSMD8 (англ. Proteasome 26S subunit, non-ATPase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 350 амінокислот, а молекулярна маса — 39 612^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFIKGRAPRA	PPRERRRATR	GGLRQVVAPP	RALGSTSRPH	FRRASVCRRR
CRKSGGLLAA	SRKMAAAAVN	GAAGFSSSGP	AATSGAVLQA	ATGMYEQLKG
EWNRKSPNLS	KCGEELGRLK	LVLLELNFLP	TTGTKLTKQQ	LILARDILEI
GAQWSILRKD	IPSFERYMAQ	LKCYYFDYKE	QLPESAYMHQ	LLGLNLLFLL
SQNRVAEFHT	ELERLPAKDI	QTNVYIKHPV	SLEQYLMEGS	YNKVFLAKGN
IPAESYTFFI	DILLDTIRDE	IAGCIEKAYE	KILFTEATRI	LFFNTPKKMT
DYAKKRGWVL	GPNNYYSFAS	QQQKPEDTTI	PSTELAKQVI	EYARQLEMIV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Proteasome 26S subunit, non-ATPase 8 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9566 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P48556 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.