EIF3F

EIF3F
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

3J8B, 3J8C

Ідентифікатори
Символи EIF3F, EIF3S5, eIF3-p47, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, MRT67
Зовнішні ІД OMIM: 603914 MGI: 1913335 HomoloGene: 2783 GeneCards: EIF3F
шифр КФ 3.4.19.12
Пов'язані генетичні захворювання
депресія клінічна[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

cysteine-type peptidase activity
translation initiation factor activity
thiol-dependent deubiquitinase
GO:0070122 peptidase activity
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
hydrolase activity
translation initiation factor binding

Клітинна компонента

цитоплазма
гіалоплазма
eukaryotic translation initiation factor 3 complex
мембрана
eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m
eukaryotic 43S preinitiation complex
eukaryotic 48S preinitiation complex

Біологічний процес

протеоліз
translational initiation
Біосинтез білків
IRES-dependent viral translational initiation
protein deubiquitination
formation of cytoplasmic translation initiation complex
cytoplasmic translational initiation

Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
8665
66085
Ensembl
ENSG00000175390
ENSMUSG00000031029
UniProt
O00303
Q9DCH4
RefSeq (мРНК)
NM_003754
NM_025344
RefSeq (білок)
NP_003745
NP_079620
Локус (UCSC) Хр. 11: 7.97 – 8 Mb Хр. 7: 108.53 – 108.54 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EIF3F (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 357 амінокислот, а молекулярна маса — 37 564[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MATPAVPVSAPPATPTPVPAAAPASVPAPTPAPAAAPVPAAAPASSSDPA
AAAAATAAPGQTPASAQAPAQTPAPALPGPALPGPFPGGRVVRLHPVILA
SIVDSYERRNEGAARVIGTLLGTVDKHSVEVTNCFSVPHNESEDEVAVDM
EFAKNMYELHKKVSPNELILGWYATGHDITEHSVLIHEYYSREAPNPIHL
TVDTSLQNGRMSIKAYVSTLMGVPGRTMGVMFTPLTVKYAYYDTERIGVD
LIMKTCFSPNRVIGLSSDLQQVGGASARIQDALSTVLQYAEDVLSGKVSA
DNTVGRFLMSLVNQVPKIVPDDFETMLNSNINDLLMVTYLANLTQSQIAL
NEKLVNL

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, факторів ініціації, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Holz M.K., Ballif B.A., Gygi S.P., Blenis J. (2005). mTOR and S6K1 mediate assembly of the translation preinitiation complex through dynamic protein interchange and ordered phosphorylation events. Cell. 123: 569—580. PMID 16286006 DOI:10.1016/j.cell.2005.10.024
  • Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 DOI:10.1261/rna.7215305
  • Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 DOI:10.1038/sj.emboj.7601765
  • Lee A.S., Kranzusch P.J., Cate J.H. (2015). eIF3 targets cell-proliferation messenger RNAs for translational activation or repression. Nature. 522: 111—114. PMID 25849773 DOI:10.1038/nature14267
  • Lee A.S., Kranzusch P.J., Doudna J.A., Cate J.H. (2016). eIF3d is an mRNA cap-binding protein that is required for specialized translation initiation. Nature. 536: 96—99. PMID 27462815 DOI:10.1038/nature18954

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з EIF3F переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3275 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 серпня 2017.
  5. UniProt, O00303 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 11
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S