DDX17

Ідентифікатори

Символи

DDX17, P72, RH70, DEAD-box helicase 17

Зовнішні ІД

OMIM: 608469 MGI: 1914290 HomoloGene: 101101 GeneCards: DDX17

Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding • RNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • hydrolase activity • nucleic acid binding • ATP-dependent activity, acting on RNA • RNA binding
Клітинна компонента	• мембрана • клітинне ядро • nuclear speck • гіалоплазма • нуклеоплазма • ядерце • цитоплазма
Біологічний процес	• GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • RNA secondary structure unwinding • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • regulation of skeletal muscle cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Альтернативний сплайсинг • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0061715 miRNA metabolic process • intracellular estrogen receptor signaling pathway • androgen receptor signaling pathway • Епітеліально-мезенхімальний перехід • myoblast differentiation • процес імунної системи • rRNA processing • mRNA processing • Сплайсинг РНК • Сайленсинг генів • defense response to virus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10521


67040

Ensembl


ENSG00000100201


ENSMUSG00000055065

UniProt


Q92841


Q501J6

RefSeq (мРНК)


NM_030881 NM_001098504 NM_001098505 NM_006386


NM_001040187 NM_152806 NM_199079 NM_199080

RefSeq (білок)


NP_001091974 NP_006377


NP_001035277 NP_690019 NP_951061 NP_951062

Локус (UCSC)

Хр. 22: 38.48 – 38.51 Mb

Хр. 15: 79.41 – 79.43 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

DDX17 (англ. DEAD-box helicase 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 729 амінокислот, а молекулярна маса — 80 272^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPTGFVAPIL	CVLLPSPTRE	AATVASATGD	SASERESAAP	AAAPTAEAPP
PSVVTRPEPQ	ALPSPAIRAP	LPDLYPFGTM	RGGGFGDRDR	DRDRGGFGAR
GGGGLPPKKF	GNPGERLRKK	KWDLSELPKF	EKNFYVEHPE	VARLTPYEVD
ELRRKKEITV	RGGDVCPKPV	FAFHHANFPQ	YVMDVLMDQH	FTEPTPIQCQ
GFPLALSGRD	MVGIAQTGSG	KTLAYLLPAI	VHINHQPYLE	RGDGPICLVL
APTRELAQQV	QQVADDYGKC	SRLKSTCIYG	GAPKGPQIRD	LERGVEICIA
TPGRLIDFLE	SGKTNLRRCT	YLVLDEADRM	LDMGFEPQIR	KIVDQIRPDR
QTLMWSATWP	KEVRQLAEDF	LRDYTQINVG	NLELSANHNI	LQIVDVCMES
EKDHKLIQLM	EEIMAEKENK	TIIFVETKRR	CDDLTRRMRR	DGWPAMCIHG
DKSQPERDWV	LNEFRSGKAP	ILIATDVASR	GLDVEDVKFV	INYDYPNSSE
DYVHRIGRTA	RSTNKGTAYT	FFTPGNLKQA	RELIKVLEEA	NQAINPKLMQ
LVDHRGGGGG	GGGRSRYRTT	SSANNPNLMY	QDECDRRLRG	VKDGGRRDSA
SYRDRSETDR	AGYANGSGYG	SPNSAFGAQA	GQYTYGQGTY	GAAAYGTSSY
TAQEYGAGTY	GASSTTSTGR	SSQSSSQQFS	GIGRSGQQPQ	PLMSQQFAQP
PGATNMIGYM	GQTAYQYPPP	PPPPPPSRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Lamm G.M., Nicol S.M., Fuller-Pace F.V., Lamond A.I. (1996). p72: a human nuclear DEAD box protein highly related to p68. Nucleic Acids Res. 24: 3739—3747. PMID 8871553 DOI:10.1093/nar/24.19.3739
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Uhlmann-Schiffler H., Rossler O.G., Stahl H. (2002). The mRNA of DEAD box protein p72 is alternatively translated into an 82-kDa RNA helicase. J. Biol. Chem. 277: 1066—1075. PMID 11675387 DOI:10.1074/jbc.M107535200
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
Shin S., Janknecht R. (2007). Concerted activation of the Mdm2 promoter by p72 RNA helicase and the coactivators p300 and P/CAF. J. Cell. Biochem. 101: 1252—1265. PMID 17226766 DOI:10.1002/jcb.21250
Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2740 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 лютого 2017.
↑ UniProt, Q92841 (англ.) . Архів оригіналу за 19 січня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.