CHAF1A

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1S4Z

Ідентифікатори

Символи

CHAF1A, CAF-1, CAF1, CAF1B, CAF1P150, P150, chromatin assembly factor 1 subunit A

Зовнішні ІД

OMIM: 601246 MGI: 1351331 HomoloGene: 4003 GeneCards: CHAF1A

Онтологія гена
Молекулярна функція	• unfolded protein binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromo shadow domain binding • identical protein binding
Клітинна компонента	• CAF-1 complex • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес	• реплікація ДНК • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • nucleosome assembly
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


10036


27221

Ensembl


ENSG00000167670


ENSMUSG00000002835

UniProt


Q13111


Q9QWF0

RefSeq (мРНК)


NM_005483


NM_013733

RefSeq (білок)


NP_005474


NP_038761

Локус (UCSC)

Хр. 19: 4.4 – 4.45 Mb

Хр. 17: 56.35 – 56.38 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CHAF1A (англ. Chromatin assembly factor 1 subunit A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 956 амінокислот, а молекулярна маса — 106 926^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLEELECGAP	GARGAATAMD	CKDRPAFPVK	KLIQARLPFK	RLNLVPKGKA
DDMSDDQGTS	VQSKSPDLEA	SLDTLENNCH	VGSDIDFRPK	LVNGKGPLDN
FLRNRIETSI	GQSTVIIDLT	EDSNEQPDSL	VDHNKLNSEA	SPSREAINGQ
REDTGDQQGL	LKAIQNDKLA	FPGETLSDIP	CKTEEEGVGC	GGAGRRGDSQ
ECSPRSCPEL	TSGPRMCPRK	EQDSWSEAGG	ILFKGKVPMV	VLQDILAVRP
PQIKSLPATP	QGKNMTPESE	VLESFPEEDS	VLSHSSLSSP	SSTSSPEGPP
APPKQHSSTS	PFPTSTPLRR	ITKKFVKGST	EKNKLRLQRD	QERLGKQLKL
RAEREEKEKL	KEEAKRAKEE	AKKKKEEEKE	LKEKERREKR	EKDEKEKAEK
QRLKEERRKE	RQEALEAKLE	EKRKKEEEKR	LREEEKRIKA	EKAEITRFFQ
KPKTPQAPKT	LAGSCGKFAP	FEIKEHMVLA	PRRRTAFHPD	LCSQLDQLLQ
QQSGEFSFLK	DLKGRQPLRS	GPTHVSTRNA	DIFNSDVVIV	ERGKGDGVPE
RRKFGRMKLL	QFCENHRPAY	WGTWNKKTAL	IRARDPWAQD	TKLLDYEVDS
DEEWEEEEPG	ESLSHSEGDD	DDDMGEDEDE	DDGFFVPHGY	LSEDEGVTEE
CADPENHKVR	QKLKAKEWDE	FLAKGKRFRV	LQPVKIGCVW	AADRDCAGDD
LKVLQQFAAC	FLETLPAQEE	QTPKASKRER	RDEQILAQLL	PLLHGNVNGS
KVIIREFQEH	CRRGLLSNHT	GSPRSPSTTY	LHTPTPSEDA	AIPSKSRLKR
LISENSVYEK	RPDFRMCWYV	HPQVLQSFQQ	EHLPVPCQWS	YVTSVPSAPK
EDSGSVPSTG	PSQGTPISLK	RKSAGSMCIT	QFMKKRRHDG	QIGAEDMDGF
QADTEEEEEE	EGDCMIVDVP	DAAEVQAPCG	AASGAGGGVG	VDTGKATLTS
SPLGAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до шаперонів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kaufman P.D., Kobayashi R., Kessler N., Stillman B. (1995). The p150 and p60 subunits of chromatin assembly factor I: a molecular link between newly synthesized histones and DNA replication. Cell. 81: 1105—1114. PMID 7600578 DOI:10.1016/S0092-8674(05)80015-7
Shibahara K., Stillman B. (1999). Replication-dependent marking of DNA by PCNA facilitates CAF-1-coupled inheritance of chromatin. Cell. 96: 575—585. PMID 10052459 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80661-3
Quivy J.-P., Grandi P., Almouzni G. (2001). Dimerization of the largest subunit of chromatin assembly factor 1: importance in vitro and during Xenopus early development. EMBO J. 20: 2015—2027. PMID 11296234 DOI:10.1093/emboj/20.8.2015
Reese B.E., Bachman K.E., Baylin S.B., Rountree M.R. (2003). The methyl-CpG binding protein MBD1 interacts with the p150 subunit of chromatin assembly factor 1. Mol. Cell. Biol. 23: 3226—3236. PMID 12697822 DOI:10.1128/MCB.23.9.3226-3236.2003
Sarraf S.A., Stancheva I. (2004). Methyl-CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly. Mol. Cell. 15: 595—605. PMID 15327775 DOI:10.1016/j.molcel.2004.06.043

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1910 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q13111 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.