DDR1

Diskoidin domen receptor familija, izoforma 1
Identifikatori
Simboli DDR1; CAK; CD167; DDR; EDDR1; MCK10; NEP; NTRK4; PTK3; PTK3A; RTK6; TRKE
Vanjski ID OMIM: 600408 MGI: 99216 HomoloGene: 68212 GeneCards: DDR1 Gene
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje nukleotida
aktivnost protein-tirozin kinaze
aktivnost transmembrankog receptora proteinske tirozin kinaze
aktivnost receptora
ATP vezivanje
aktivnost transferaze
Celularna komponenta integralno sa membranom plazme
membrana
Biološki proces fosforilacija proteinske aminokiseline
ćelijska adhezija
transmembranki receptor proteinska tirozin kinaza, signalni put
Pregled RNK izražavanja
podaci
Ortolozi
Vrsta Čovek Miš
Entrez 780 12305
Ensembl ENSG00000137332 ENSMUSG00000003534
UniProt Q08345 O35407
RefSeq (mRNA) NM_001954 NM_007584
RefSeq (protein) NP_001945 NP_031610
Lokacija (UCSC) Chr c6_COX:
30.99 - 31.01 Mb
Chr 17:
35.29 - 35.31 Mb
PubMed pretraga [1] [2]

DDR1, ili CD167a (klaster diferencijacije 167a), je ljudski gen[1] koji je pripadnik broj 1 familije diskoidin domen receptora.

Receptor tirozin kinaze (RTK) igraju ključnu ulogu u komunikaciji ćelija sa njihovim mikro okruženjem. Ti molekuli su uključeni u regulaciju ćelijskog rasta, diferencijacije i metabolizma. Protein kodiran ovim genom je RTK koji je široko izražen u normalnim i transformisanim epitelnim ćelijama, i koji je aktiviran kolagenom. Ovaj protein pripada potfamiliji receptora tirozin kinaza koje sadrže homologni region sa Dictyostelium discoideum proteinom diskoidin I u njihovom ekstracelularnom domenu. Njegova auto-fosforilacija se postiže svim do sada testiranim kolagenima (tip I - VI). In situ studije i Northern-blot analiza su pokazale da je izražavanje ovog protein ograničeno na epitelske ćelije, posebno u bubrezima, plućima, gastrointestinalnom traktu, i mozgu. Dodatno, ovaj protein je značajno preizražen i u nekoliko ljudskih tumora iz dojki, jajnika, jednjaka, pedijatrijskog mozga. Ovaj gen se nalazi na hromozomu 6p21.3 u blizini nekoliko HLA klasa I gena. Alternativno splajsovanje (engl. splicing) ovog gena proizvodi nekoliko transkript varijanti.[1]

Reference

  1. ^ а б „Entrez Gene: DDR1 discoidin domain receptor family, member 1”. 

Literatura

  • Edelhoff S, Sweetser DA, Disteche CM (1995). „Mapping of the NEP receptor tyrosine kinase gene to human chromosome 6p21.3 and mouse chromosome 17C.”. Genomics. 25 (1): 309—11. PMID 7774938. doi:10.1016/0888-7543(95)80144-B. 
  • Shelling AN; Butler R; Jones T; et al. (1995). „Localization of an epithelial-specific receptor kinase (EDDR1) to chromosome 6q16.”. Genomics. 25 (2): 584—7. PMID 7789998. doi:10.1016/0888-7543(95)80065-T. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Weiner TM, Liu ET, Craven RJ, Cance WG (1995). „Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors.”. Ann. Surg. Oncol. 1 (1): 18—27. PMID 7834423. doi:10.1007/BF02303537. 
  • Laval S; Butler R; Shelling AN; et al. (1995). „Isolation and characterization of an epithelial-specific receptor tyrosine kinase from an ovarian cancer cell line.”. Cell Growth Differ. 5 (11): 1173—83. PMID 7848919. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Kato JY, Matsuoka M, Strom DK, Sherr CJ (1994). „Regulation of cyclin D-dependent kinase 4 (cdk4) by cdk4-activating kinase.”. Mol. Cell. Biol. 14 (4): 2713—21. PMID 8139570. 
  • Di Marco E; Cutuli N; Guerra L; et al. (1993). „Molecular cloning of trkE, a novel trk-related putative tyrosine kinase receptor isolated from normal human keratinocytes and widely expressed by normal human tissues.”. J. Biol. Chem. 268 (32): 24290—5. PMID 8226977. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Perez JL; Shen X; Finkernagel S; et al. (1994). „Identification and chromosomal mapping of a receptor tyrosine kinase with a putative phospholipid binding sequence in its ectodomain.”. Oncogene. 9 (1): 211—9. PMID 8302582. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Johnson JD, Edman JC, Rutter WJ (1993). „A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain.”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (12): 5677—81. PMID 8390675. doi:10.1073/pnas.90.12.5677. 
  • Perez JL, Jing SQ, Wong TW (1996). „Identification of two isoforms of the Cak receptor kinase that are coexpressed in breast tumor cell lines.”. Oncogene. 12 (7): 1469—77. PMID 8622863. 
  • Valent A; Meddeb M; Danglot G; et al. (1996). „Assignment of the NTRK4 (trkE) gene to chromosome 6p21.”. Hum. Genet. 98 (1): 12—5. PMID 8682498. doi:10.1007/s004390050152. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Playford MP; Butler RJ; Wang XC; et al. (1996). „The genomic structure of discoidin receptor tyrosine kinase.”. Genome Res. 6 (7): 620—7. PMID 8796349. doi:10.1101/gr.6.7.620. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Sakuma S; Saya H; Tada M; et al. (1997). „Receptor protein tyrosine kinase DDR is up-regulated by p53 protein.”. FEBS Lett. 398 (2-3): 165—9. PMID 8977099. doi:10.1016/S0014-5793(96)01234-3. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Nemoto T; Ohashi K; Akashi T; et al. (1998). „Overexpression of protein tyrosine kinases in human esophageal cancer.”. Pathobiology. 65 (4): 195—203. PMID 9396043. doi:10.1159/000164123. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Tanaka K; Nagayama Y; Nakano T; et al. (1998). „Expression profile of receptor-type protein tyrosine kinase genes in the human thyroid.”. Endocrinology. 139 (3): 852—8. PMID 9492013. doi:10.1210/en.139.3.852. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Vogel W, Gish GD, Alves F, Pawson T (1998). „The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen.”. Mol. Cell. 1 (1): 13—23. PMID 9659899. doi:10.1016/S1097-2765(00)80003-9. 
  • Shrivastava A; Radziejewski C; Campbell E; et al. (1998). „An orphan receptor tyrosine kinase family whose members serve as nonintegrin collagen receptors.”. Mol. Cell. 1 (1): 25—34. PMID 9659900. doi:10.1016/S1097-2765(00)80004-0. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Vogel W; Brakebusch C; Fässler R; et al. (2000). „Discoidin domain receptor 1 is activated independently of beta(1) integrin.”. J. Biol. Chem. 275 (8): 5779—84. PMID 10681566. doi:10.1074/jbc.275.8.5779. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Foehr ED; Tatavos A; Tanabe E; et al. (2000). „Discoidin domain receptor 1 (DDR1) signaling in PC12 cells: activation of juxtamembrane domains in PDGFR/DDR/TrkA chimeric receptors.”. FASEB J. 14 (7): 973—81. PMID 10783152. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Weiner HL; Huang H; Zagzag D; et al. (2001). „Consistent and selective expression of the discoidin domain receptor-1 tyrosine kinase in human brain tumors.”. Neurosurgery. 47 (6): 1400—9. PMID 11126911. doi:10.1097/00006123-200012000-00028. CS1 одржавање: Експлицитна употреба et al. (веза)
  • Mohan RR, Mohan RR, Wilson SE (2001). „Discoidin domain receptor (DDR) 1 and 2: collagen-activated tyrosine kinase receptors in the cornea.”. Exp. Eye Res. 72 (1): 87—92. PMID 11133186. doi:10.1006/exer.2000.0932. 
  • Nicholas C. Price; Lewis Stevens (1999). Fundamentals of Enzymology: The Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins (Third изд.). USA: Oxford University Press. ISBN 019850229X. 
  • Eric J. Toone (2006). Advances in Enzymology and Related Areas of Molecular Biology, Protein Evolution (Volume 75 изд.). Wiley-Interscience. ISBN 0471205036. 
  • Branden C; Tooze J. Introduction to Protein Structure. New York, NY: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0. 
  • Irwin H. Segel. Enzyme Kinetics: Behavior and Analysis of Rapid Equilibrium and Steady-State Enzyme Systems (Book 44 изд.). Wiley Classics Library. ISBN 0471303097. 
  • William P. Jencks (1987). Catalysis in Chemistry and Enzymology. Dover Publications. ISBN 0486654605. 

Spoljašnje veze

  • п
  • р
  • у
EGF receptorska familija
EGFR • ERBB2 • ERBB3 • ERBB4
Insulin receptor familija
IGF1R • INSR • INSRR
PDGF receptor familija
CSF1R • FLT3 • KIT • PDGFR (PDGFRA, PDGFRB)
FGF receptor familija
FGFR1 • FGFR2 • FGFR3 • FGFR4
VEGF receptor familija
VEGFR1 • VEGFR2 • VEGFR3 • VEGFR4
HGF receptor familija
MET • RON
Trk receptor familija
NTRK1 • NTRK2 • NTRK3
EPH receptor familija
EPHA1 • EPHA2 • EPHA3 • EPHA4 • EPHA5 • EPHA6 • EPHA7 • EPHA8 • EPHB1 • EPHB2 • EPHB3 • EPHB4 • EPHB5 • EPHB6 • EPHX
LTK receptor familija
LTK • ALK
TIE receptor familija
TIE • TEK
ROR receptor familija
ROR1 • ROR2
DDR receptor familija
DDR1 • DDR2
PTK7 receptor familija
RYK receptor familija
RYK
MuSK receptor familija
ROS receptor familija
ROS1
AATYK receptor familija
AATYK • AATYK2 • AATYK3
AXL receptor familija
AXL • MER • TYRO3
RET receptor familija
RET
nekategorisani
STYK1
ABL familija
ABL1 • ARG
ACK familija
ACK1 • TNK1
CSK familija
CSK • MATK
FAK familija
FAK • PYK2
FES familija
FES • FER
FRK familija
FRK • BRK • SRMS
JAK familija
JAK1 • JAK2 • JAK3 • TYK2
SRC-A familija
SRC • FGR • FYN • YES1
SRC-B familija
BLK • HCK • LCK • LYN
TEC familija
TEC • BMX • BTK • ITK • TXK
SYK familija
SYK • ZAP70
B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
  • п
  • р
  • у
1-50
CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) • CD2 • CD3 (γ, δ, ε) • CD4 • CD5 • CD6 • CD7 • CD8 (a) • CD9 • CD10 • CD11 (a, b, c) • CD13 • CD14 • CD15 • CD16 (A, B) • CD18 • CD19 • CD20 • CD21 • CD22 • CD23 • CD24 • CD25 • CD26 • CD27 • CD28 • CD29 • CD30 • CD31 • CD32 (A, B) • CD33 • CD34 • CD35 • CD36 • CD37 • CD38 • CD39 • CD40 • CD41 • CD42 (a, b, c, d) • CD43 • CD44 • CD45 • CD46 • CD47 • CD48 • CD49 (a, b, c, d, e, f) • CD50
51-100
CD51 • CD52 • CD53 • CD54 • CD55 • CD56 • CD57 • CD58 • CD59 • CD61 • CD62 (E, L, P) • CD63 • CD64 (A, B, C) • CD66 (a, b, c, d, e, f) • CD68 • CD69 • CD70 • CD71 • CD72 • CD73 • CD74 • CD78 • CD79 (a, b) • CD80 • CD81 • CD82 • CD83 • CD84 • CD85 (a, d, e, h, j, k) • CD86 • CD87 • CD88 • CD89 • CD90 • CD91- CD92 • CD93 • CD94 • CD95 • CD96 • CD97 • CD98 • CD99 • CD100
101-150
CD101 • CD102 • CD103 • CD104 • CD105 • CD106 • CD107 (a, b) • CD108 • CD109 • CD110 • CD111 • CD112 • CD113 • CD114 • CD115 • CD116 • CD117 • CD118 • CD119 • CD120 (a, b) • CD121 (a, b) • CD122 • CD123 • CD124 • CD125 • CD126 • CD127 • CD129 • CD130 • CD131 • CD132 • CD133 • CD134 • CD135 • CD136 • CD137 • CD138 • CD140b • CD141 • CD142 • CD143 • CD144 • CD146 • CD147 • CD148 • CD150
151-200
CD151 • CD152 • CD153 • CD154 • CD155 • CD156 (a, b, c) • CD157 • CD158 (a, d, e, i, k) • CD159 (a, c) • CD160 • CD161 • CD162 • CD163 • CD164 • CD166 • CD167 (a, b) • CD168 • CD169 • CD170 • CD171 • CD172 (a, b, g) • CD174 • CD177 • CD178 • CD179 (a, b) • CD181 • CD182 • CD183 • CD184 • CD185 • CD186 • CD191 • CD192 • CD193 • CD194 • CD195 • CD196 • CD197 • CDw198 • CDw199 • CD200
201-250
CD201 • CD202b • CD204 • CD205 • CD206 • CD207 • CD208 • CD209 • CDw210 (a, b) • CD212 • CD213a (1, 2) • CD217 • CD218 (a, b) • CD220 • CD221 • CD222 • CD223 • CD224 • CD225 • CD226 • CD227 • CD228 • CD229 • CD230 • CD233 • CD234 • CD235 (a, b) • CD236 • CD238 • CD239 • CD240CE • CD241 • CD243 • CD244 • CD246 • CD247- CD248 • CD249
251-300
CD252 • CD253 • CD254 • CD256 • CD257 • CD258 • CD261 • CD262 • CD264 • CD265 • CD266 • CD267 • CD268 • CD269 • CD271 • CD272 • CD273 • CD274 • CD275 • CD276 • CD278 • CD279 • CD280 • CD281 • CD282 • CD283 • CD284 • CD286 • CD288 • CD289 • CD290 • CD292 • CDw293 • CD294 • CD295 • CD297 • CD298 • CD299
301-350
CD300A • CD301 • CD302 • CD303 • CD304 • CD305 • CD306 • CD307 • CD309 • CD312 • CD314 • CD315 • CD316 • CD317 • CD318 • CD320 • CD321 • CD322 • CD324 • CD325 • CD326 • CD328 • CD329 • CD331 • CD332 • CD333 • CD334 • CD335 • CD336 • CD337 • CD338 • CD339 • CD340 • CD344 • CD349 • CD350
  • п
  • р
  • у
Teme
Tipovi
  • B enzm: 1.1/2/3/4/5/6/7/8/10/11/13/14/15-18, 2.1/2/3/4/5/6/7/8, 2.7.10, 2.7.11-12, 3.1/2/3/4/5/6/7, 3.1.3.48, 3.4.21/22/23/24, 4.1/2/3/4/5/6, 5.1/2/3/4/99, 6.1-3/4/5-6
Portali:
  •  Molekularna i ćelijska biologija
  •  Hemija