CD247

CD247
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1TCE, 1YGR, 2HAC, 2OQ1, 3IK5, 3IOZ, 4XZ1

Идентификаторы
ПсевдонимыCD247, CD3-ZETA, CD3H, CD3Q, CD3Z, IMD25, T3Z, TCRZ, CD247 molecule, CD3zeta
Внешние IDOMIM: 186780 MGI: 88334 HomoloGene: 12818 GeneCards: CD247
Расположение гена (человек)
1-я хромосома человека
Хр.1-я хромосома человека[1]
1-я хромосома человека
Расположение в геноме CD247
Расположение в геноме CD247
Локус1q24.2Начало167,430,640 bp[1]
Конец167,518,610 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
1-я хромосома мыши
Хр.1-я хромосома мыши[2]
1-я хромосома мыши
Расположение в геноме CD247
Расположение в геноме CD247
Локус1 H2.3|1 73.14 cMНачало165,616,250 bp[2]
Конец165,704,846 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung
Наибольшая экспрессия в
  • subcutaneous adipose tissue
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • связывание с белками плазмы
  • transmembrane signaling receptor activity
  • связывание похожих белков
  • гомодимеризация белка
  • protein tyrosine kinase binding
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • часть мембраны
  • alpha-beta T cell receptor complex
  • клеточная мембрана
  • T cell receptor complex
  • мембрана
Биологический процесс
  • cell surface receptor signaling pathway
  • mitigation of host defenses by virus
  • T cell receptor signaling pathway
  • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis
  • regulation of immune response
  • вирусный процесс
  • protein homotetramerization
  • protein homotrimerization
  • adaptive immune response
  • immune system process
  • interleukin-2 production
  • positive regulation of protein localization to cell surface
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

919

12503

Ensembl

ENSG00000198821

ENSMUSG00000005763

UniProt

P20963

Q3UU54
P24161

RefSeq (мРНК)

NM_000734
NM_198053
NM_001378515
NM_001378516

NM_001113391
NM_001113392
NM_001113393
NM_001113394
NM_031162

RefSeq (белок)

NP_000725
NP_932170
NP_001365444
NP_001365445

NP_112439.1
NP_001106862.1
NP_001106862
NP_001106863
NP_001106864

NP_112439

Локус (UCSC)Chr 1: 167.43 – 167.52 MbChr 1: 165.62 – 165.7 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

Т-клеточный поверхностый гликопротеин CD3, ζ-цепь (англ. T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, CD247, CD3Z) — мембранный белок, дзета-субъединица Т-клеточного рецептора. Продукт гена человека CD247[5].

Функции

Субъединичная структура Т-клеточного рецептора. ζ-Субъединица показана зелёным цветом.

Дзета (ζ) субъединица Т-клеточного рецептора вместе с альфа/бета и гамма/дельта гетеродимерами и CD3-гамма-, CD3-дельта-, CD3-эпсилон-субъединицами образуют мультимолекулярный комплекс Т-клеточного рецептора. ζ-цепь (CD247) играет важную роль в связывании процесса распознавания рецептором антигена и нескольких внутриклеточных сигнальных путей. Низкая экспрессия ζ-цепи приводит к нарушению иммунного ответа. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию двух изоформ[6].

Структура

CD247 состоит из 164 аминокислот, молекулярная масса 18,7 кДа. В рецепторе находится в гомодимерной форме.

Взаимодействия

CD247 взаимодействует с JAK3[7] и Unc-119[8].

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000198821 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000005763 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Weissman A. M., Hou D., Orloff D. G., Modi W. S., Seuanez H., O'Brien S. J., Klausner R. D. Molecular cloning and chromosomal localization of the human T-cell receptor zeta chain: distinction from the molecular CD3 complex (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1988. — December (vol. 85, no. 24). — P. 9709—9713. — doi:10.1073/pnas.85.24.9709. — PMID 2974162. — PMC 282845.
  6. Entrez Gene: CD247 CD247 molecule  (неопр.).
  7. Tomita K., Saijo K., Yamasaki S., Iida T., Nakatsu F., Arase H., Ohno H., Shirasawa T., Kuriyama T., O'Shea J. J., Saito T. Cytokine-independent Jak3 activation upon T cell receptor (TCR) stimulation through direct association of Jak3 and the TCR complex (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — July (vol. 276, no. 27). — P. 25378—25385. — doi:10.1074/jbc.M011363200. — PMID 11349123.
  8. Gorska M. M., Stafford S. J., Cen O., Sur S., Alam R. Unc119, a novel activator of Lck/Fyn, is essential for T cell activation (англ.) // J. Exp. Med.[англ.] : journal. — Rockefeller University Press[англ.], 2004. — February (vol. 199, no. 3). — P. 369—379. — doi:10.1084/jem.20030589. — PMID 14757743. — PMC 2211793.

Литература

  • Geyer M., Fackler O. T., Peterlin B. M. Structure--function relationships in HIV-1 Nef (англ.) // EMBO Rep.[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 2, no. 7. — P. 580—585. — doi:10.1093/embo-reports/kve141. — PMID 11463741. — PMC 1083955.
  • Greenway A. L., Holloway G., McPhee D. A., Ellis P., Cornall A., Lidman M. HIV-1 Nef control of cell signalling molecules: multiple strategies to promote virus replication (англ.) // J. Biosci.[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 28, no. 3. — P. 323—335. — doi:10.1007/BF02970151. — PMID 12734410.
  • Stove V., Verhasselt B. Modelling thymic HIV-1 Nef effects (англ.) // Curr. HIV Res.[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 4, no. 1. — P. 57—64. — doi:10.2174/157016206775197583. — PMID 16454711.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400