IRES

IRES v RNA genomu polioviru je významné pro nasednutí ribozomu a translaci celého genomu v polyprotein
Další významy jsou uvedeny na stránce IRES (rozcestník).

IRES (zkratka z angl. internal ribosome entry site, tzn. „vnitřní místo pro vstup ribozomu“[1]) je zvláštní sekvence přítomná v oblasti před začátkem genu, která umožňuje nasednutí ribozomu a tedy spuštění translace. Jedná se o výjimku z pravidla, že ribozom nasedá na 5' čepičky, jak je to běžné u eukaryotické mRNA.[2] IRES se zřejmě vážou do speciálního místa na ribozomu, tzv. E-místa, které přibližuje IRES startkodon (AUG) k P místu ribozomu, kde se odehrává iniciace translace.[3]

IRES místa (dost výrazně vzdálená od 5' začátku molekuly) mají nejen normální eukaryotické mRNA, ale také (možná zejména) různé viry.[3] K buněčným mRNA s IRES místy patří namátkou Apaf-1 mRNA, Bcl2 mRNA, c-myc mRNA, eIF4G mRNA, hsp70 mRNA a mnohé další. Z virů byla IRES místa nalezena např. u viru SV40, u poliovirů, u viru hepatitidy C i A, nicméně také třeba u viru tabákové mozaiky.[4][5]

Reference

  1. TYČ, Dimitrij. Využití IRES sekvencí při expresi proteinu v rostlinách; bakalářská práce. Praha: Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze; Katedra fyziologie rostlin, 2009. Dostupné online. 
  2. Oxford dictionary of biochemistry and molecular biology; revised edition. Příprava vydání R. Cammack et al. New York: Oxford university press, 2006. ISBN 0-19-852917-1. 
  3. a b LODISH, Harvey, et al.. Molecular Cell Biology. New York: W.H. Freedman and Company, 2004. Dostupné online. ISBN 0-7167-4366-3. 
  4. http://iresite.org/IRESite_web.php?page=browse_viral_transcripts
  5. http://iresite.org/IRESite_web.php?page=browse_cellular_transcripts
Pahýl
Pahýl
Tento článek je příliš stručný nebo postrádá důležité informace.
Pomozte Wikipedii tím, že jej vhodně rozšíříte. Nevkládejte však bez oprávnění cizí texty.
Typy RNA
Syntéza proteinů
Zpracování RNA
  • malá jaderná RNA (snRNA)
  • malá jadérková RNA (snoRNA)
  • guide RNA (gRNA)
  • RNáza P
  • RNáza MRP
  • Y RNA
  • Regulace genové exprese
  • antisense RNA (aRNA)
  • CRISPR RNA
  • dlouhá nekódující RNA (lncRNA)
  • mikroRNA (miRNA)
  • RNA interagující s PIWI (piRNA)
  • siRNA asociovaná s repeticemi (rasiRNA)
  • malá interferující RNA (siRNA)
  • siRNA působící v trans (ta-siRNA)
  • přirozené siRNA působící v cis (cis-NATs)
  • Regulační elementy na RNA
  • IRES
  • Riboswitch
  • SECIS element
  • Parazitické RNA elementy
  • RNA virus
  • Viroid
  • s mezikrokem v podobě DNA: RetrotranspozonRetrovirus
  • Ostatní
  • telomerázová RNA
  • Vault RNA
  • Subgenomická mRNA (sgRNA)