SMG5

SMG5
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتينOrtholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين

2HWY

معرفات
أسماء بديلة SMG5, EST1B, LPTS-RP1, LPTSRP1, SMG-5, nonsense mediated mRNA decay factor, nonsense mediated mRNA decay factor
معرفات خارجية الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 610962 MGI: MGI:2447364 HomoloGene: 9095 GeneCards: 23381
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية

• protein phosphatase 2A binding
• histone deacetylase binding
• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني
• telomeric DNA binding
• ubiquitin protein ligase binding
• ribonuclease activity
• ribonucleoprotein complex binding
• telomerase RNA binding

مكونات خلوية

• سيتوبلازم
• عصارة خلوية
• نواة
• telomerase holoenzyme complex

عمليات حيوية

• regulation of dephosphorylation
• تفكك متوسط بلا معنى
• mRNA export from nucleus
• regulation of telomere maintenance
• regulation of telomere maintenance via telomerase
• regulation of RNA stability
• RNA phosphodiester bond hydrolysis
• telomere maintenance via telomerase

المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي


المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
أنواع الإنسان الفأر
أنتريه 23381 229512
Ensembl ENSG00000198952 ENSMUSG00000001415
يونيبروت

Q9UPR3

Q6ZPY2

RefSeq (رنا مرسال.)

‏NM_001323614، ‏NM_001323615، ‏NM_001323616، ‏NM_001323617 NM_015327، ‏NM_001323614، ‏NM_001323615، ‏NM_001323616، ‏NM_001323617

‏NM_178246، ‏XM_006501343، ‏XM_006501345، ‏XM_011240087، ‏XM_036163049، ‏XM_036163050، ‏XR_004941306، ‏XR_004941307 NM_173188، ‏NM_178246، ‏XM_006501343، ‏XM_006501345، ‏XM_011240087، ‏XM_036163049، ‏XM_036163050، ‏XR_004941306، ‏XR_004941307

RefSeq (بروتين)

‏NP_001310544، ‏NP_001310545، ‏NP_001310546، ‏NP_056142 NP_001310543، ‏NP_001310544، ‏NP_001310545، ‏NP_001310546، ‏NP_056142

‏XP_006501406، ‏XP_006501408، ‏XP_011238389، ‏XP_036018942، ‏XP_036018943 NP_839977، ‏XP_006501406، ‏XP_006501408، ‏XP_011238389، ‏XP_036018942، ‏XP_036018943

الموقع (UCSC n/a Chr 3: 88.24 – 88.27 Mb
بحث ببمد [1] [2]
ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنساناعرض/عدّل فأر

SMG5‏ (SMG5, nonsense mediated mRNA decay factor) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SMG5 في الإنسان.[1][2][3][4]

الوظيفة

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

الأهمية السريرية

هذا القسم فارغ أو غير مكتمل. ساهم في توسيعه. (يوليو 2018)

المراجع

  1. ^ Reichenbach P، Hoss M، Azzalin CM، Nabholz M، Bucher P، Lingner J (أبريل 2003). "A human homolog of yeast Est1 associates with telomerase and uncaps chromosome ends when overexpressed". Curr Biol. ج. 13 ع. 7: 568–74. DOI:10.1016/S0960-9822(03)00173-8. PMID:12676087.
  2. ^ "Entrez Gene: SMG5 Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans)". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
  3. ^ Glavan F، Behm-Ansmant I، Izaurralde E، Conti E (نوفمبر 2006). "Structures of the PIN domains of SMG6 and SMG5 reveal a nuclease within the mRNA surveillance complex". EMBO J. ج. 25 ع. 21: 5117–25. DOI:10.1038/sj.emboj.7601377. PMC:1630413. PMID:17053788.
  4. ^ Snow BE، Erdmann N، Cruickshank J، Goldman H، Gill RM، Robinson MO، Harrington L (أبريل 2003). "Functional conservation of the telomerase protein Est1p in humans". Curr Biol. ج. 13 ع. 8: 698–704. DOI:10.1016/S0960-9822(03)00210-0. PMID:12699629.

قراءة متعمقة

  • Nakajima D، Okazaki N، Yamakawa H، وآخرون (2003). "Construction of expression-ready cDNA clones for KIAA genes: manual curation of 330 KIAA cDNA clones". DNA Res. ج. 9 ع. 3: 99–106. DOI:10.1093/dnares/9.3.99. PMID:12168954.
  • Kikuno R، Nagase T، Ishikawa K، وآخرون (1999). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIV. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Res. ج. 6 ع. 3: 197–205. DOI:10.1093/dnares/6.3.197. PMID:10470851.
  • Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
  • Ohnishi T، Yamashita A، Kashima I، وآخرون (2004). "Phosphorylation of hUPF1 induces formation of mRNA surveillance complexes containing hSMG-5 and hSMG-7". Mol. Cell. ج. 12 ع. 5: 1187–200. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00443-X. PMID:14636577.
  • Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
  • Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
  • Unterholzner L، Izaurralde E (2005). "SMG7 acts as a molecular link between mRNA surveillance and mRNA decay". Mol. Cell. ج. 16 ع. 4: 587–96. DOI:10.1016/j.molcel.2004.10.013. PMID:15546618.
  • Fukuhara N، Ebert J، Unterholzner L، وآخرون (2005). "SMG7 is a 14-3-3-like adaptor in the nonsense-mediated mRNA decay pathway". Mol. Cell. ج. 17 ع. 4: 537–47. DOI:10.1016/j.molcel.2005.01.010. PMID:15721257.
  • Azzalin CM، Lingner J (2006). "The human RNA surveillance factor UPF1 is required for S phase progression and genome stability". Curr. Biol. ج. 16 ع. 4: 433–9. DOI:10.1016/j.cub.2006.01.018. PMID:16488880.
  • Gregory SG، Barlow KF، McLay KE، وآخرون (2006). "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1". Nature. ج. 441 ع. 7091: 315–21. DOI:10.1038/nature04727. PMID:16710414.
  • Lee H، Sengupta N، Villagra A، وآخرون (2006). "Histone deacetylase 8 safeguards the human ever-shorter telomeres 1B (hEST1B) protein from ubiquitin-mediated degradation". Mol. Cell. Biol. ج. 26 ع. 14: 5259–69. DOI:10.1128/MCB.01971-05. PMC:1592721. PMID:16809764.
معرفات كيميائية
  • ع
  • ن
  • ت
جينات الكروموسوم 1
جينات الكروموسوم 1
  • أيقونة بوابةبوابة طب
  • أيقونة بوابةبوابة علم الأحياء الخلوي والجزيئي
  • أيقونة بوابةبوابة الكيمياء الحيوية
أيقونة بذرة

هذه بذرة مقالة عن جين على كروموسوم 1 بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

التصنيفات الطبية
المعرفات الخارجية